慈中書院的教育教學(xué)管理全部由慈溪中學(xué)負(fù)責(zé)，任課教師為慈溪中學(xué)優(yōu)秀骨干教師，學(xué)生統(tǒng)一參與慈溪中學(xué)本部的一些教學(xué)和教育活動(dòng)，適度使用慈溪中學(xué)先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)設(shè)備;資源共享，同步發(fā)展。

學(xué)校秉承慈溪中學(xué)在其漫長(zhǎng)的辦學(xué)歷史中積淀下來的優(yōu)良傳統(tǒng)，并根據(jù)書院自己的辦學(xué)目標(biāo)和相應(yīng)特點(diǎn)，逐步形成獨(dú)特的管理體系和教育模式：培養(yǎng)目標(biāo)個(gè)性化——拓寬個(gè)性發(fā)展空間，實(shí)行有差異的分層次教育，使各層次的學(xué)生都得到最大限度的發(fā)展;試行小班化辦學(xué)模式，以滿足社會(huì)和家長(zhǎng)對(duì)小班化教育的需求。教育措施人性化——明確要求，尊重學(xué)生，重視疏導(dǎo)，養(yǎng)成氣質(zhì);為高校培養(yǎng)和輸送基礎(chǔ)扎實(shí)、個(gè)性鮮明、氣質(zhì)高雅、學(xué)有特長(zhǎng)、富有創(chuàng)新意識(shí)的優(yōu)秀學(xué)生。課程設(shè)置多元化——建立體現(xiàn)本校特色的課程體系，并充分利用國(guó)內(nèi)外的優(yōu)質(zhì)教育資源，與國(guó)外名校建立溝通渠道，為愿意直接去國(guó)外進(jìn)行深造的學(xué)生創(chuàng)造條件。教學(xué)管理生本化——培養(yǎng)學(xué)生良好的思維品質(zhì)和學(xué)習(xí)習(xí)慣，加強(qiáng)基本技能培養(yǎng)和學(xué)習(xí)方法的指導(dǎo);科學(xué)教育和人文熏陶并重，追求優(yōu)質(zhì)高效，激勵(lì)自主發(fā)展。