北京市鐵路第二中學于1955年建校——由北京鐵路分局籌建的鐵路職工子弟學校;1978年被評選為全國鐵路系統(tǒng)重點中學;2004年轉(zhuǎn)為西城區(qū)政府辦學，更名為“北京市鐵路第二中學”。按照西城區(qū)擴大優(yōu)質(zhì)教育資源的整體部署， 2005年與原四十二中合并，并于當年被評為“北京市示范性普通高中”，2007年與原鐵三中合并。2020年，成立了小學部;2021年，成立了幼兒部。成為西城區(qū)重點打造的涵蓋學前、小學、初中、高中學段，十二年一貫制的完全中學。

1964年，毛澤東主席對學校首任校長魏蓮一的來信做了批示：學校各項工作都要有利于培養(yǎng)學生“在德、智、體諸方面生動活潑地主動地得到發(fā)展”。主席的批示成為學校貫徹黨的教育方針、全面推進素質(zhì)教育的思想引領(lǐng)。多年來，學校不斷深化教育改革，落實立德樹人的根本任務(wù)，彰顯了“以人為本和諧發(fā)展”的辦學理念，明確了“創(chuàng)辦卓有成就的精品名校”的辦學目標，提出了“真誠友善、科學素養(yǎng)、國際視野、國家棟梁”的育人目標。

學校目前有兩個校區(qū)，北校區(qū)位于北京市西城區(qū)月壇西街5號，南校區(qū)位于北京市西城區(qū)三里河東路9號。校園占地面積42716平方米，建筑面積57327平方米。小學部及幼兒園在北校區(qū)，擁有相對獨立的校(園)區(qū)。

學校擁有一個團結(jié)務(wù)實的領(lǐng)導班子和一支高素質(zhì)的教師隊伍，在深化教育教學改革中，不斷構(gòu)建科學的課程體系，堅持“五育并舉”，培養(yǎng)學生的核心素養(yǎng)。加強學生道德品行、心理健康、行為習慣、法律法規(guī)教育;注重科技教育，培養(yǎng)學生創(chuàng)新思維及動手能力;發(fā)揮女排傳統(tǒng)校的優(yōu)勢，注重培養(yǎng)學生健康體魄;學校擁有先進的辦學理念、現(xiàn)代化的教學設(shè)施、優(yōu)秀的師資團隊、豐富的校園文化、科學的管理制度，教育教學質(zhì)量節(jié)節(jié)攀升，社會美譽度越來越高。

學校曾先后榮獲：北京市示范性高中校、北京市黨建示范點、北京市中小學科技教育示范校、北京市排球傳統(tǒng)校、北京市文明禮儀示范校、北京市交通安全先進單位、西城區(qū)全面實施素質(zhì)教育優(yōu)類學校、西城區(qū)示范高中聯(lián)合體成員校、西城區(qū)初中建設(shè)工程先進學校、西城區(qū)科研先進單位、西城區(qū)心理教育示范校、西城區(qū)平安校園等稱號。